艺术学院音乐分院提供研究生三个专业的研究方向:教堂音乐方向、音乐教育方向和钢琴表演和教育方向。每个专业都有不同的关注点并教导学生就业于音乐部门、教授音乐领域或是个人工作室教音乐。为了超越区域性专门化,音乐学院通过研究生教育培养专业性高水平的音乐演奏人才、有竞争力的独奏人才、音乐教学人才,有历史知识和音乐作品分析能力的音乐人才和能够在专业领域具有写普和研究能力的人才。教堂音乐专业的研究生能得到两个学位,一个是音乐硕士学位教堂音乐方向,需要完成38学分。这个专业包括毕森神学院的一部分课程,但由艺术学院管理。另一个是神学硕士学位。学生重点学习交通音乐,需要完成96学分。本学位由毕森神学院管理并包括神学硕士专业的大部分内容以及音乐硕士专业的专业课课程,学生可以得到双学位:音乐硕士和神学硕士。
通过本专业的学习,神学硕士(教堂)的学生在毕业后,成为教堂艺术家、教堂音乐家、教堂音响师、教堂调音师、教堂乐器制作者等职业工作。