香港中文大学计算机科学理学硕士课程的目标为：教授硕士层次的计算机科学知识，包括让学生：掌握最先进的资讯科技技术、新兴的软件科技，以及计算机科学的最新研究主题；了解、分析、管理、处理真实生活的工作场所中面对的资讯科技问题；留意计算机科学，以及国际以至本地计算机行业的最新发展。教授基本的共通能力，包括：写作及口语传意技巧；文献研究方法；用以解难的分析技巧，例如批判分析、判明问题、设计实用的解决方法等。培养学生的正面态度及令学生乐意：与团队的队员有效地沟通及合作；把握成为领袖的机会；提出和发表新构思和想法，同时抱有批判及开放的心态；解决问题时，鉴别出也运用到相应的计算机科学的知识；考虑社会、经济、环境、健康及安全等各方面，改善处理问题的方法。