东京大学主校区设在东京都内文京区本乡，地铁发达交通便利。

东大诞生于1877年，初设法学、理学、文学、医学四个学部，是日本第一所国立大学，也是亚洲最早的西制大学之一。学校于1886年被更名为“帝国大学”，这也是日本建立的第一所帝国大学。1897年，易名“东京帝国大学”，以区分同年在京都创立的京都帝国大学。二战后的1947年9月，其正式定名为“东京大学” 。

校园的有附属学校、工同研究部门，实验实习基地（如农场、林场、地震、火山、天文等观察站）、师生员工宿舍等分布于全国各地。原校本区的旧校门枣红门所在地，原为江户时代藩主迎接家庭成员的地方，大门被漆成朱红色。

赤门是日本东京大学本乡校区在本乡通侧的一个大门，原为加贺藩的御守殿门，“赤门”为御守殿门的俗称，此乃因为御守殿门皆漆为朱红色之故。依古代日本习俗，御守殿门一旦受灾损毁便不能重建，而东京大学的赤门是唯一留存下来的御守殿门，已有百年以上的历史，殊为难得，因此曾被日本政府列为国宝，现则指定为重要文物。

东京大学下设10个学部、15个研究生招生院所，在50个本科专业、96个研究生专业招生。

法学部

医学部

工学部

文学部

理学部

农学部

经济学部

教养学部

教育学部

药学部

东京大学综合实力稳居日本国内第一位，与排名第二位的京都大学共同构成日本科教金字塔的最尖端。东京大学所有学科门类均无明显短板，在理学、医学、文学、工学、政治学等领域拥有世界级的学术影响力，在土木、建筑学领域更是居于最尖端队列。

东京大学有国际生宿舍，学生也是可以申请的。但是宿舍数量是有限的，所以申请不到的学生只能申请租宿舍周边的房子。

东京大学图书馆创立于1877年，原馆在1923年的日本关东大地震中付之一炬。新的总图书馆于1928年受洛克菲勒基金资助兴建；整个东京大学图书馆系统包括总图书馆及60余个系所分馆。

截止2013年，东京大学图书馆馆藏图书合计926万册，其中日文图书488万册，外文图书428万册，有各类学术刊物16万册；2012年全年购入及受捐图书文献共计15万9千余册。

东京大学校区设在东京都内文京区本乡，占地面积 40 公顷 ，全校绝大部分机构均在这里。另外在目黑区驹场另建一新校区，为教养学部及部分后勤设施所在地。附属学校、工同研究部门，实验实习基地(如农场、林场、地震、火山、天文等观察站)、师生员工宿舍等分布于全国各地。原校本区的旧校门枣红门所在地，原为江户时代藩主迎接家庭成员的地方，大门被漆成朱红色。后经东京大地震和第二次世界大战的破坏，1949年被国家定为重点文物。1991年重新修缮一新，十分有气派，现红门成为东京大学的代名词。