滋贺大学大津校区起源于1874年建立在大津市的滋贺辫常规师范学校，1943年经重组为滋贺师范学校。1949年5月，滋贺大学的成立使滋贺师范学校与滋贺教员培训学校合并并归属于滋贺大学的人文教育学部。彦根校区起源于1922年建于彦根市的高等商业学校，1944年更名为彦根经济专科学校。1949年5月，随滋贺大学的成立彦根经济专科学校归属为滋贺大学的经济学部。大学本部设立在彦根校区。

滋贺大学设有教育学部(学校教育教员养成课程、情报教育课程、环境教育课程)、经济学部(经济学科、会计学科、企业经营学科、会计情报学科、情报管理学科、社会系统学科)，大学院设有教育学研究科(硕士课程：学校教育专攻、障害儿童教育专攻、教科教育专攻)、经济学研究科(博士前期课程：经济学专攻、经营学专攻、环球会计学专攻、博士后期课程：经济经营处理专攻)。 作为国立大学经济学部，滋贺大学经济学部拥有日本最大规模的6学科(经济学科、会计学科、企业经营学科、会计情报学科、情报管理学科、社会系统学科)20类讲座，是综合经济学部，教员数约100名，学生数每学年约500名。

1949年滋贺大学图书馆随滋贺大学的成立而建成。现在的图书馆分为彦根校区的主图书馆和大津校区教育学部的附属图书馆。总藏书量达598,001本。图书馆为本科生准备了许多基础入门书类同时也为研究生和学校教师收集了大量的相关专业资料。图书馆里还收藏着许多珍贵的书籍，其中如收藏在主图书馆的[Great Soviet Encyclopedia]66本装和收藏在附属图书馆的《西国立志篇》可谓另一部珍藏。图书馆向全校师生开放并提供各类与教育相关的图书，杂志，电子图片及音像资料。与此同时本校图书馆还面向附近的居民以及社会公众开放。图书馆的书籍可以通过校园网来查得。