现在的大学是2002年设立的。旧山梨大学因为并入山梨医科大学而废止。新大学的首任校长来自山梨医科大学。该大学同时也附设葡萄酒的研究场所，也是全日本唯一的一所。
1795年甲府学问所徽典馆成立(后来的山梨师范学校);1921年山梨县实业补习学校教员培养所设立(后来的山梨青年师范学校);1938年山梨高等工业学校设立(后来的山梨工业专门学校);1949年山梨师范学校、山梨青年师范学校、山梨工业专门学校合并为新制山梨大学，设有学艺学部、工学部; 1966年 学艺学部改称教育学部; 1978年山梨医科大学设立，设立医学部; 1995年山梨医科大学医学部设立护理学科; 2002年山梨大学成立(山梨大学与山梨医科大学合并);2012年山梨大学增设生命环境学部
教育科学部,医学部,工学部,生命环境学部;
教育学研究科大学院; 医学系大学院;
工学系大学; 特别支援教育特别专业科
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